Esta investigación se realizó en el arroyo Guasú, ubicado en el Departamento Central, abarcando distritos de San Lorenzo, Ñemby y San Antonio, extendiéndose por 9,5 km hasta desembocar al río Paraguay, su cuenca abarca 44,9 km2 de superficie. Se establecieron 5 puntos de muestreo para dos estaciones del año (primavera y otoño). Se aplicaron dos índices de calidad de agua, uno de ellos el BMWP/Aguapey (Biological Monitoring Working Party) modificado para el país y se basa en la identificación a nivel de familias de macroinvertebrados acuáticos capturados, y el ICA (Índice de Calidad de Agua) que analiza parámetros fisicoquímicos y microbiológicos para la determinación. A partir de las muestras se analizaron 9 parámetros fisicoquímicos y microbiológicos, además de la diversidad de familias de macroinvertebrados encontrados, buscando lograr el objetivo del trabajo de determinar la calidad del agua del arroyo Guasú. Los resultados obtenidos de las variables fisicoquímicas indican que las aguas del arroyo se encuentran con una calidad mala con valor promedio de 42 y el índice BMWP/Aguapey, presenta un resultado promedio de 12,5 indicando aguas de calidad muy crítica por la baja diversidad de macroinvertebrados colectados, siendo todos indicadores de elevada contaminación del agua.